Zpočátku se věřilo, že Ötzi zemřel na podchlazení během zimní bouře. Později se spekulovalo, že Ötzi mohl být obětí rituálního obětování. Když však v roce 2001 rentgen a výpočetní tomografie ukázaly, že Ötzi měl v době smrti v levém rameni uvíznutý hrot šípu a mozkové poranění po úderu do hlavy, bylo vcelku jasno, že Ötzi byl zavražděn.

Po vraždě se většinou provádí pitva. Ötzi, člověk z mladší doby kamenné, na ni musel čekat 5300 let. Byla však důkladná a trvala devět hodin. Pitva byla provedená v Jihotyrolském archeologickém muzeu v italském Bolzanu a mimo jiné potvrdila, že Ötzi nebyl v době své smrti úplně zdravý. Trpěl zejména kornatěním cév a podle nalezené bakterie „Borrelia burgdorferi“ pravděpodobně i lymskou boreliózou. Vražda tedy zřejmě jen uspíšila jeho smrt z přirozených důvodů, která podle vědců provádějících pitvu, nebyla daleko. O zajímavé teorii, proč vyhynuli naši předkové, jsme informovali v tomto článku.

Pravdu se pochopitelně již nikdy nedozvíme, ale jeví se jako pravděpodobné, že Ötziho někdo stopoval, a pak ze zálohy vystřelil šíp, který ho zasáhl do zad pod lopatkou, částečně pronikl do plic a způsobil tak smrtelné zranění. Útočník mu pak ještě „pro jistotu“ zasadil silnou ránu sekerou do hlavy.

I po provedené pitvě zůstávají nezodpovězené otázky. Proč se Ötzi vydal až do nadmořské výšky 3210 metrů? Z jakého důvodu ho vrah tak vysoko do hor sledoval? A především, proč mu po vraždě nevzal nic z jeho věcí, zejména měděnou sekeru, která v té době představovala značný majetek? Odpovědi na tyto otázky však zůstanou navždy tajemstvím.